Seveda pa operacijski sistemi in priloženi programi pogosto niso edina orodja, ki jih želimo uporabljati v ročnih računalnikih. K sreči je še cela mala industrija izdelovalcev, ki ponujajo dodatne programe za najrazličnejša opravila, od zabave do poslovne rabe. Tako za platformo PocketPC kot je na voljo obilo programov, pri čemer je slednji še vedno nekoliko v prednosti.