V Pocket PC 2003, zaenkrat znanem še pod delovnim imenom Ozone, bodo odpravljeni predvsem nekateri hrošči različice 2002 in imel bo nekaj dodatnih zmožnosti.
Jedro bo temeljilo na Windows CE .NET 4.1 (pri Pocket PC 2002 temelji na različici 3.0). Nova različica bo združljiva s starimi programi, tako da bo uporabnikom z novim sistemom že ob samem izidu na voljo veliko programske opreme.