Po namestitvi program ves čas deluje v ozadju in le občasno, pravzaprav kar pogosto piskanje nas opozarja, da je program odkril in prestregel vsiljivca (še napogosteje gre za »zlonamerni« piškotek). Ena izmed dobrih lastnosti PestPatrola je samodejno obnavljanje prek spleta, ki skrbi, da je vedno pripravljen na najnovejše mutacije škodljivcev. Žal pa je program v današnjih časih kar nekoliko preveč samostojen.