Opozoriti velja, denimo, na izbiro -M prevajalnika GNU C. Makedepend podpira precej različnih izbir, zato je natančno branje priročnika ( makedepend) zanj tudi koristno. Omenimo še, da predlaga priročnik za GNU Make drug način izdelovanja seznama soodvisnosti, pri katerem obnovimo seznam ob vsakem prevajanju in ne le ob klicu cilja depend. Prednost tega je seveda to, da je seznam vedno posodobljen, slabost pa, da velikokrat brez potrebe seznam regeneriramo, kar pripomore k počasnejšemu prevajanju.