NetOp ima tudi lasten program za delo z datotekami (ki močno spominja na Windows Commanderja), s katerim je kopiranje datotek nadvse preprosto opravilo, za hitrejši prenos pa jih program tudi sam stisne. NetOp ima seveda tudi posebne gumbe za prenos ukazov, kot je ctrl++del ter možnost kopiranja odložišča iz gostiteljevega računalnika in vanj. Pri delu z večjim številom gostiteljev je mogoče določiti hkraten prenos datotek ali pa zagon programa na vse, kar je seveda še posebej primerno pri nameščanju popravkov ali nove programske opreme.