Potreben je le prevajalnik za C ter lex, ki je del sistema na vsakem spodobnem Unixu. Ko ga prvič poženemo, Bogofilter v domači imenik uporabnika prepiše datoteko .bogofilter.cf, v kateri lahko uporabnik spreminja nastavitve.
Poleg osnovne, Grahamove metode, Bogofilter zdaj podpira tudi dva naprednejša algoritma, Robinsonovega in Fisherjevega.