Tudi na področju VPN je Linksys dovolj močan, vendar ne popoln. Za začetek pogrešamo podporo protokolom PPTP in L2TP, kar pomeni, da se v oddaljeno pisarno, ki dostop VPN zagotavlja z Linksysom, ne bomo mogli povezati kar z običajnimi Okni in klicnim dostopom. In nasprotno, Linksys kot odjemalec ne bo znal vzpostaviti klicne povezave (na zahtevo) do nekega Microsoftovega strežnika RAS, ki ga imamo morda v podjetju.