Izbira videokonferenčnih programov je zelo pestra - poleg vsake videokonferenčne kamere najdemo tudi ploščo z različnimi pripomočki, med katerimi je ponavadi tudi program za videokonference. Pri izbiranju je treba paziti predvsem na združljivost; najlaže gre, če sogovorniki uporabljajo isti program, če to ni mogoče, pa je treba izbrati programsko opremo, ki je združljiva s standardom H.323 (H.320 za neposredno povezavo ISDN) in podpira ustrezne avdio in video kodeke.