Sam IPSec namreč ne določa matematičnih algoritmov za šifriranje, temveč zgolj način uporabe le-teh pri obdelavi podatkov za varen prenos po internetu. S tem je zagotovljeno najvišja stopnja varnosti, saj je mogoče šifrirne mehanizme, ki jih bo nekoč povozil čas, enostavno zamenjati z novimi in močnejšimi. Izvedbe nove različica protokola IP (IPv6) zato že same po sebi obsegajo mehanizem IPSec.