Čeprav bi morda za hip lahko DiscJuggler primerjali z že opisanim programom CloneCD, ki je tudi namenjen presnemavanju, pa gre za dokaj različna izdelka.
Bistvena razlika med njima je v tem, da DiscJuggler ni namenjen toliko presnemavanju zaščitenih nosilcev, kot je to odlika CloneCD, ima pa zato neprimerno zmogljivejši uporabniški vmesnik, ki zelo poenostavi delo z več pogoni hkrati. To pa seveda ne pomeni, da DiscJuggler ne zmore prebrati nobenega zaščitenega nosilca, saj primerja izvirnik in dvojnik na zelo nizki ravni, težave mu povzročajo le najbolj trdovratne zaščite.