Njihov zapis je - po pričakovanju - enak v vseh Wolframovih programih, zato lahko dokumente, ustvarjene s CalculationCentrom, odpiramo tudi v Mathematici. Učenje programa precej skrajšajo tako imenovani krmilniki (controllers, okenski programi jim pravijo čarovniki), ki z aktivnimi predlogami olajšajo pisanje ukazov. Ukazna zgradba Mathematice, ki je posledica zgodovinskega spogledovanja z Unixom, je namreč prikladna za zahtevne, vsakodnevne uporabnike programa, popolnoma neprimerna pa je za začetnike in občasne uporabnike.