Dolgo je veljalo, da je jezero ledeniškega izvora, vendar raziskave v zadnjem času kažejo, da je mogoča tudi drugačna razlaga njegovega nastanka.
Ljudsko izročilo, ki ga je upesnil v svoji Legendi o Rabeljskem jezeru, pripoveduje, da je tu nekoč stala vas. Možno je, da je podobno kot v Zajzeri prvotno ledeniško jezero že zasul grušč in je res nastala v dolini ravnica z naseljem, kot ga opisuje pesnik.