Edina njihova pomanjkljivost je, da so primerne za uporabo le pri otrocih oziroma osebah, ki tehtajo do 40 kg, saj je število teh celic v popkovnični krvi manjše kot v kostnem mozgu. Matične celice iz popkovnice lahko relativno enostavno in neboleče za mati in otroka, odvzamemo iz popkovnice takoj pri porodu. Potem nam je bilo celo rečeno na Šoli za starše, da v Sloveniji tega postopka odvzema še ne delajo, ampak smo se pozanimali in smo naknadno izvedeli, da je v Ljubljani to možno.