Najbolj so ti problemi izpostavljeni pri ukrepu sofinanciranje izobraževanja in usposabljanja zaposlenih za konkurenčnost in zaposljivost. Namreč gre za to, da se lahko za iste zadeve financirajo zadruge iz različnih virov iz različnih shem, ki jih dajejo različna ministrstva in zato so bile tudi v tem primeru tega programa izvzete. Glede javnega razpisa za neposredne spodbude za skupne razvojne investicijske projekte, ki so bili tudi v vprašanju izpostavljene.