Temu je delno botrovalo pomanjkljivo financiranje, delno pa dejansko pomanjkanje volje in razumevanje s strani visokošolskih učiteljev glede duha bolonjske reforme in priložnosti, ki jih ponuja. Tu je treba priznati, da tudi Svet za visoko šolstvo ni bil kos vlogi, ki mu je bila zaupana, predvsem na področju zagotavljanja kakovosti in kredibilnega akreditiranja visokošolskih programov. Zaradi njegovih institucionalnih pomanjkljivosti se ni uspel vključiti v evropsko mrežo preverjanja kakovosti, "European Network for Quality Assesment".