Organizacijska in kadrovska struktura obstoječih direktoratov je pomanjkljiva, nejasno so določena razmerja med direktoratoma. Njune naloge in pristojnosti se prekrivajo, kar zagotovo ovira določitev razmerja strateških in operativnih dejavnosti. Vse to zagotovo tudi slabi zmožnost strateškega razvojnega načrtovanja ter sodelovanja v evropskih delovnih skupinah.