V času izplačevanja subvencije bo zavod; zaenkrat še ni nič izplačal, ampak bo izplačal skladno s pogodbami; bo zavod mesečno s križanjem podatkov o delavcih vključenih v ukrep in podatkov Zdravstvene zavarovalnice preverjal, ali so delavci še zaposleni pri delodajalcu. Na polovici izvajanja subvencioniranja in pred izplačilom zadnjega zahtevka oziroma vsakokrat, ko bo s strani sindikatov, medijev ali Inšpektorata Republike Slovenije za delo prejel sporočilo, da delodajalec vključenim delavcem ni izplačal plač ali obveznih prispevkov, bo to uradno preveril s križanjem podatkov tudi z Davčnim uradom. V pogodbi o delovnem subvencioniranju polnega delovnega časa sklenjen med zavodom in delodajalcem je določeno, da pogodbeni stranki soglašata, da imajo zavod in ostali pristojni organi v Republiki Sloveniji pravico administrativnega in finančnega spremljanja in vrednotenja izvajanja ukrepa in nadzora nad porabo dodeljenih sredstev.