ESA95 tudi ne upošteva tokov med EU in Slovenijo, saj Evropske komisije ne zanimajo finančni tokovi med EU in Slovenijo, ker ti ne vplivajo na dolgoročno vzdržnost javnih financ v skladu z določbami Pakta o rasti in stabilnosti.
Ob revidiranju izkaza zaključnega računa je Računsko sodišče ugotovilo, da je bil ob bilanci državnega proračuna napačno izkazan proračunski presežek v višini 37 milijonov in 54.000 evrov, saj med tekočimi transferi niso izkazana izplačila sredstev upravičencev za vlaganja v javno telekomunikacijsko omrežje v znesku 43 milijonov in 605.000 evrov. Prav tako pa tudi niso izkazani tekoči odhodki od obresti za založena sredstva in zaračunani stroški Slovenske odškodninske družbe v znesku skoraj 2 milijona 600.000 evrov.