V preostalem delu je bila direktiva namreč že implementirana. Predlog zakona tako uvaja rešitev, po kateri imajo vse raziskovalne organizacije, ki izpolnjujejo pogoje za izvajanje raziskovalne in razvojne dejavnosti, določene s tem zakonom in so zato vpisane v evidenco raziskovalnih organizacij pri Javni agenciji za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije, pooblastilo za sklepanje sporazumov o gostovanju. Ministrstvo je tudi odgovorno za nadzor nad izvajanjem sporazuma o gostovanju, ki ga lahko prenese tudi na Javno agencijo za raziskovalno dejavnost Republike Slovenije.