Ker je Zakon o preprečevanju korupcije naravnan izključno preventivno, predstavlja Zakon o nezdružljivosti opravljanja javne funkcije s pridobitno dejavnostjo dobro podlago za odkrivanje morebitne obstoječe korupcije. V zvezi z navajanjem predlagateljev, da je sistem ureditve po Zakonu o nezdružljivosti opravljanja javne funkcije s pridobitno dejavnostjo manj pregleden in učinkovit kot sistem po Zakonu o preprečevanju korupcije, pa Vlada Republike Slovenije meni, da navedeno ne drži, ker Zakon o nezdružljivosti opravljanja javne funkcije s pridobitno dejavnostjo učinkoviteje in ponekod strožje normira področje konflikta interesov kot Zakon o preprečevanju korupcije. Glede navedbe, da ni sprejemljivo, da se k uskladitvi z odločbo Ustavnega sodišča pristopi zgolj formalno preko drugačne sestave komisije po Zakonu o nezdružljivosti opravljanja javne funkcije s pridobitno dejavnostjo Vlada opozarja na odločbo Ustavnega sodišča, po kateri je treba zakon v
tem delu uskladiti z ustavo.