Neusklajenost Zakona o zadrugah z Zakonom o gospodarskih družbah ustvarja v praksi pravne praznine, kljub splošnemu sklicevanju na smiselno uporabo Zakona o podjetjih. Te praznine se kažejo v tem, da so določbe Zakona o podjetjih oziroma Zakona o gospodarskih družbah v številnih primerih smiselno neuporabe za Zakon o zadrugah, zlasti tam, kjer se navezujejo na točno določeno pravno-organizacijsko obliko gospodarske družbe, ki je pri zadrugah ne poznamo, ter zaradi prenekaterih posebnosti zadrug, ki za podjetja oziroma gospodarske družbe ne pridejo v poštev. Gre za vrsto sprememb, ki natančneje in smiselno sledijo spremembam prava družb na ostalih področjih, na področju gospodarskih družb, sodelovanja delavcev pri upravljanju, prisilne poravnave, stečaja in likvidacije, finančnega poslovanja, računovodstva in revidiranja.