Ker fitosanitarni pregled poleg pregleda dokumentacije o istovetnosti zajema še zdravstveni pregled pošiljk, je to zahtevalo več dela fitosanitarnih inšpektorjev, predvsem v, kjer se preklada in začasno skladišči veliko število pošiljk plodov, lesa in drugega rastlinskega blaga v tranzitu. Predlagane spremembe zakonu dajejo podlago, da se glede na oceno tveganja, da ni nevarnosti za zdravstveno varstvo rastlin, opusti zdravstveni pregled tranzitne pošiljke, s tem pa zmanjšajo tudi stroški pristojbin, kar lahko neposredno poveča konkurenčno sposobnost in tudi drugih subjektov, ki so vključeni v tranzitne postopke. Z dopolnjenimi določbami za pobiranje, odvajanje, izterjavo in zastaranje pristojbin za fitosanitarne preglede ter za določitve primerne višine globe za prekrške želi zakon doseči učinkovito izvajanje predpisanih ukrepov, katerih izid je v javnem interesu ohranjanja zdravja rastlin in biotske raznovrstnosti.