Drugi sestanek z Evropsko komisijo je bil 20.9., 12.12.2006, smo s programski dokumenti seznanili tudi Državni zbor, Odbor za evropske zadeve. 18.1.2007 smo imeli tretji tehnični sestanek z Evropsko komisijo. Na osnovi vseh teh navedenih prispevkov, aktivnosti, usklajevanj je Vlada 16.2. potrdila uradni predlog programskih dokumentov in tudi uradno posredovala Bruslju, medtem ko so pa že vsa predhodna usklajevanja ves čas potekala in so torej vsebinsko, še posebej v smislu razdelitev sredstev po OP-jih in razvojnih prioritetah, programski dokumenti s Komisijo načelom usklajeni. V tem delu naprej pričakujemo predvsem usklajevanje na tehnično-oblikovnih elementih, kot je recimo opredelitev kazalnikov, razmejitev med različnimi vsebinami, mehanizmi in spremljanjem podobno.