Ker zakon ne ureja verske svobode, ampak govori o verski skupnosti in Cerkvah, saj nikjer ne omenja velike skupine državljanov, to so neverujoči. Ker posega v z Ustavo opredeljeno ločenost Cerkve od države, ker z javnimi sredstvi financira versko dejavnost, kar je nedopustno, ker je diskriminatoren do manjših verskih skupnosti, ker skozi opredelitev družbeno koristne organizacije financira verske skupnosti in dejavnosti, ki jih opravlja tudi številne organizacije civilne družbe in to brez javnega razpisa, kar je diskriminatorno do organizacij civilne družbe. Ker se pri financiranju iz naslova javnih financ ne upošteva podjetniških virov in prihodkov iz naslova premoženja, ki jih imajo verske skupnosti.