Drugi del financiranja je programsko financiranje, ki je dolgoročno, petletno, pogodbe so sklenjene, in se v to, razen v kontroli - in tu je ena od šibkosti dosedanjega sistema - do sedaj v nobeni točki, ne v programski ne v projektni in tudi ne v ustanoviteljskih obveznostih ni bilo definiranih in izvajanih kontrol, kontrol s strani ministrstva in kontrol s strani same organizacije. Menimo, da je kontrola, tako interna kot eksterna, nujno potrebna. To je razlog, zakaj se to uvaja.