Še posebej del, ki se nanaša na neodvisnost oziroma samostojnost univerz.
Kljub temu, da je vsem trem univerzam prepuščeno v celoti upravljanje z več kot deset milijardami premoženja, pa se bo s spremembo sestave v upravnih odborih univerz uvedel politični nadzor, kar je vsekakor v nasprotju z ustavno rešitvijo in neodvisnostjo univerz je zgolj virtualna. Ključen problem je torej vrivanje politike v upravne odbore univerz, kar lahko pomeni vračanje kriterija družbeno politične primernosti oziroma uvajanje komisarskega načina upravljanja univerz.