S tem se seveda lahko v prioriteten položaj postavljajo nekateri projekti, ki so bili morda prej pripravljeni, pa vendar niso dobri. S tem je onemogočena prava primerjava projektov in njihova kvaliteta ter izvedba. V postopku so favorizirana tudi nekatera svetovalna podjetja, ki so se prej ukvarjala s pripravo regionalnih razvojnih programov, sedaj pa nastopajo kot svetovalci podjetjem za pripravo projektov.