Zato so predvsem manjše, manj poznane in za javnost manj atraktivne, podzemne jame ne redko izpostavljali številnim posegom raznih ljubiteljev, ki s svojim lomastenjem po podzemnem svetu napravijo veliko škode, tako na biotopih kakor tudi na ostalih naravnih lepotah, ki so se oblikovale v tisočletnih in očem skritih procesih.
Vsaka jama je zanimiv, ponavadi dokaj zaprt ekosistem, v katerem so naravni pogoji povzročili, da so se oblikovale za zanimive kapniške in druge strukture, v mnogih pa se nahajajo tudi endemične živalske in rastlinske vrste.
Nenadzorovano vdiranje v jamski svet največkrat zelo ogroža jamske lepote in posebnosti, še posebej živega sveta.