Gre za popolnoma drugo situacijo, kot je v primeru operacijskih miz, ko je investitor klinični center. V primeru, ko je gre za investitor ministrstvo, ministrstvo poskrbi za vse okoliščine, organizacijske, strokovne podlage, preverjanja, ki pripeljejo do ustreznih strokovnih odločitev. V primeru nabave opreme je ministrstvo za zdravje pooblastilo klinični center, da izvede razpis, in izvede nabavo.