Druga težava, ki nastopa v statističnih regijah, je financiranje razvojnih programov znotraj statističnih regij in financiranje regionalnih razvojnih agencij. Občine s posebnimi razvojnimi problemi morajo seveda pripraviti ustrezne programe in financirati določen odstotek, glede na vrednost tega razvojnega programa tudi regionalno razvojno agencijo. To pomeni, da občine, ki imajo razvojne probleme, financirajo tudi to institucijo, ki dejansko takšno občino potem še slabi glede na njeno finančno zmožnost.