Pogodba poleg tega predvideva, da je treba - o čemer je bilo nekaj rečenega že v diskusiji o prejšnjih dveh zakonih - sprejeti oziroma predložiti program razgradnje in program odlaganja nizko - in srednjeradioaktivnih odpadkov in izrabljenega jedrskega goriva v 12 mesecih po uveljavitvi tega zakona oziroma te pogodbe. Predvideva, da je treba imenovati strokovno organizacijo, ki bo to pripravila v 60 dneh po uveljavitvi tega zakona. Res pa sedmi odstavek 10. člena te pogodbe predvideva, da če ne pride do skupne rešitve pri odlaganju nizko - in srednjeradioaktivnih odpadkov, potem v dveh letih po prenehanju obratovanja vsaka od pogodbenic fizično prevzame polovico jedrskih odpadkov.