Sektor varovanja voda je pravzaprav razdeljen po svojih pristojnostih med tri resorje: ministrstvo za okolje, ministrstvo za zdravje in ministrstvo za kmetijstvo, gozdarstvo in prehrano.
Za kvalitetno in za zdravstveno neoporečno pitno vodo, to kar je bilo pravzaprav vaše osrednje vprašanje, je zadolženo ministrstvo za zdravje, kmetijski sektor pa je zadolžen za okoljsko prijazno kmetovanje in obvladovanje vseh vrst emisij, ki bi zaradi kmetijske dejavnosti poslabšale stanje okolja, zlasti pitne vode. Ministrstvo za okolje, prostor in energijo pa je zadolženo za varovanje vodotokov in pa podzemnih voda, ki so v glavnem v večini Sloveniji tudi vir pitne vode.