S tem so jasno definirana razmerja med državnim zborom, kot najpomembnejšim organom odločanja o nacionalni raziskovalni in razvojni dejavnosti, med vlado, ki pripravi predlog programa in je odgovorna za izvrševanje, ter svetom za znanost in tehnologijo Republike Slovenije, ki pripravi izhodišča in usmeritve za predlog nacionalnega programa.
Ker bo nacionalni program podlaga za določanje obsega sredstev državnega proračuna za izvajanje raziskovalne in razvojne dejavnosti, je za določanje strateških razvojnih področij in udejanjanja nacionalnih prioritet bistvenega pomena. S tem pa je vloga državnega zbora odločilna.