Pristojni organ za fitofarmacevtska sredstva in naprave za nanašanje fitofarmacevtskih sredstev v Republiki Sloveniji bo Uprava Republike Slovenije za varstvo rastlin in semenarstvo pri ministrstvu za kmetijstvo, gozdarstvo in prehrano. Nadzor nad izvajanjem določb tega zakona pa bo izvajala kmetijska, fitosanitarna in zdravstvena inšpekcija.