In drugič. V 9. točki drugega dela taistega protokola kot novost protokol določa, da evropski parlament in nacionalni parlamenti skupaj določijo, kako organizirati in spodbujati učinkovito in redno medparlamentarno sodelovanje znotraj Evropske unije. Ker velja splošno prepričanje, da medvladna konferenca ne bo posegla v besedilo protokola, kot ga določa osnutek ustavne pogodbe, kar lahko seveda sklepam tudi iz besed predsednika vlade, ki je med vprašanji, s katerimi se soočajo na zasedanjih medvladne konference, protokola ni navedel, vzporedno že potekajo razprave o ciljih in načinih medparlamentarnega sodelovanja v nacionalnih parlamentih ter na srečanjih predsednikov nacionalnih parlamentov ob sodelovanju evropskega parlamenta.