Zato je vlada pri pripravi amandmajev k predlogu zakona za drugo obravnavo upoštevala in usklajevala predloge, mnenja in stališča komisije vlade Republike Slovenije za vprašanje prikritih grobišč v prejšnji in novi zasedbi, komisije vlade Republike Slovenije za izvajanje zakona o popravi krivic, ministrstva za okolje in prostor, ministrstva za kulturo, ministrstva za pravosodje, ministrstva za notranje zadeve, ministrstva za finance in službe za zakonodajo in pravne zadeve vlade Republike Slovenije.
Amandmaji vlade so tako medresorsko usklajeni, usklajeni pa so tudi z vladno namero, da reši vprašanje prikritih grobišč, nastalih med in po drugi svetovni vojni, in mrtvim povrne dostojanstvo. Zlasti slednje je narekovalo pripraviti amandmaje k 2., 3., 4. in 13. členu tako, da so v vojnih grobiščih nediskriminatorno obravnavane vse človeške žrtve vseh vojn na Slovenskem.