Zavod tako načrtuje v letu 2002 primanjkljaj v višini 3,2 milijarde slovenskih tolarjev, medtem ko v letu 2003 predvideva presežek v višini 500 milijonov tolarjev.
Zaradi zaostrene finančne situacije v zdravstveni blagajni letošnjega leta - pričakuje se okoli 12 milijard primanjkljaja - vlada predlaga državnemu zboru, da sprejme povečanje prispevnih stopenj delodajalcev za obvezno zdravstveno zavarovanje za 0,2% točke in za enak odstotek tudi povečanje prispevne stopnje za upokojence, ki jih plačuje pokojninska blagajna. Z zvišanjem prispevne stopnje bi zdravstvena blagajna v letu 2002 pridobila dodatnih 5,8 milijarde SIT prihodkov.