Izjeme za odstopanje od predpisanih režimov varstva so možne samo, če ni ogroženo ugodno stanje vrste in to v natančno določenih primerih. O teh izjemah mora država vsaki dve leti predložiti evropski komisiji natančno poročilo o razlogih za izjemo, vključno z opisom okoliščin ter znanstvenimi podatki, ki so bili pri tem upoštevani, o sredstvih, pripravah in metodah za ulov ali ubijanje, o pristojnem organu, ki določa in preverja pogoje, o izvajalcih izjemnega posega ter o uporabljenih nadzornih ukrepih in dobljenih rezultatih. Vsekakor gre za zahteve Evropske unije, ki se jim ne bo moč izogniti in za izpolnjevanje katerih Slovenija nujno potrebuje že omenjeno strategijo upravljanja z rjavim medvedom.