Sklad je bil nenazadnje tudi ustanovljen z utemeljitvijo, da bo peljal procese v zvezi z vračanjem nekdaj podržavljenih kmetijskih zemljišč in gozdov.
Nekaj sodnih odločb je bilo takšnih, ki so odločitve sklada kmetijskih zemljišč in gozdov Republike Slovenije anulirale v tem smislu, da bi lahko posameznim interesentom vračali nadomestna zemljišča. Nadomestna zemljišča se bodo vračala v skladu s kriteriji, ki jih predpisuje zakon o kmetijskih zemljiščih, kjer je jasno naveden prednostni vrstni red, kdo je do tega upravičen.