Urbanizacija tega območja, pravzaprav moramo reči, da je Škocjanski zatok tak kot je, ni samo plod delovanja narave, ampak seveda tudi človeka, človekove dejavnosti in razvoja. Še enkrat vam lahko povem, da sta narava in človek tu skupaj ustvarila neko izjemno zanimivo biotopsko vrednoto in habitat. Ta narava, ta urbanizacija je v zadnjem času seveda z zasipavanjem in odlaganjem materialov je Škocjanskemu zatoku naredila ogromno škodo in povzročila ogroženje obstoja rastlinskih in živalskih vrst, ki živijo v tem biotopu.