Praksa je pokazala, da je veliko težav pri izvajanju zakona o denacionalizaciji nastopilo zato, ker niso bile jasno določene vse stranke v postopku in zato niso mogle biti ugotovljene vse pravno relevantne okoliščine, glede na vrednost stvari, ki je predmet podržavljenja. Med drugim ti popravki vključujejo tudi več kot 6.000 najemnikov denacionaliziranih stanovanj.
Zaščita normalnega gospodarjenja sklada kmetijskih zemljišč in gozdov v skladu z gozdno-gospodarskimi načrti oziroma kmetijskimi zemljišči, je naslednje vprašanje, kjer je z zakonom določeno, da upravičencem, ob takem gospodarjenju sklada, ne pripada odškodnina za zmanjšano vrednost po 26. členu zakona o denacionalizaciji.