Do sedaj zasebne raziskovalne institucije niso mogle konkurirati za sredstva oziroma so imele manjšo možnost konkurirati v primerjavi z državnimi raziskovalnimi zavodi.
Tretja novost, ki jo pa zakon prinaša in ki je bila pravzaprav najbolj "diskutabel", najbolj vroča tema, je pa ustanovitev dveh agencij. Univerze, predvsem univerza v Ljubljani vztraja, da bi moralo biti - ne vem - pet ali šest agencij za posamezna področja, ministrstvo pa meni, da sta dve agenciji dovolj.