Prav iz te neurejenosti izvirajo vsi problemi, tudi zmeda z upravljanjem nekaterih atraktivnih vodotokov, toda o tem kasneje.
Zanimiva je tudi ugotovitev Pihlerja, s katero se v celoti strinjam, da so med najhujšimi kritiki zavodovega upravljanja z vodami, prav raziskovalci samega zavoda, ki opozarjajo, da naj bi zavod vzrejal avtohtone ribe ter da je v ta namen od države dobil tudi štiri ribogojnice. Poleg tega naj bi upravljal z varstvenimi vodami, za katere seveda velja varstveni režim.