Na ta način je ministrstvo poverilo del pomembnih nalog v zvezi s pripravljanjem in izvajanjem proračuna izvajalcu, ki ni bil izbran v skladu s predpisi. Zaradi poslovne in že tradicionalne prepletenosti nalog med obema partnerjema, je tako sklepanje pogodbe neobičajno, zato je proračunska inšpekcija tudi predlagala, da se opravi revizija postopkov in pooblastil, s katerimi bi se določilo, katere naloge mora prevzeti ministrstvo za kmetijstvo, gozdarstvo in prehrano in katere mora oddati prek javnega razpisa. Na očitke proračunske inšpekcije ministrstvo odgovarja, da je poslovno združenje prehrane Slovenije naslednik organizacij, ki opravljajo podobna strokovna opravila že 20 let.