Kot posledica dodelitve izločenih voda drugim upravljalcem, in ker zavodu za ribištvo ti vodni rajoni niso bili odvzeti, je v vodah tolminskega in bohinjskega ribiškega okoliša nastala zmeda, saj sta se pojavila dva upravljalca teh voda, vsak s svojimi ribolovnimi dovolilnicami, pravili in ribiškimi čuvaji.
Zmeda na tem področju se nadaljuje še naprej, saj je zavod na upravno sodišče Republike Slovenije vložil tožbo zaradi odprave odločb ministrstva za kmetijstvo, gozdarstvo in prehrano in zahteva izdajo začasne odredbe. Upravno sodišče je zahtevi zavoda ugodilo ter odložilo izvajanje dokončne odločbe upravne enote Tolmin, zadržanje izvajanja odločbe upravne enote Radovljica pa zavrnilo.