Zato je bil v tej odločbi napovedan prenos javnih pooblastil po 2. in 5. točki na kasnejšo končno odločbo ministrstva za kmetijstvo, gozdarstvo in prehrano. Dne 30.6.1998 so bila z odločbo ministrstva odvzeta javna pooblastila za opravljanje nalog iz 3. in 6. točke, ki so ji bila podeljena z delno odločbo ministrstva za kmetijstvo dne 28.5.1998.
Na tako odločbo se je veterinarska zbornica Slovenije pritožila najprej na ministrstvo, z namenom, da se odloži izvršba odločbe, vendar je ministrstvo to zavrnilo.