Sekretariat tudi meni, da glede vprašanja načina izvajanja sodnega nadzora nad posebnimi metodami in sredstvi, bo potrebno v bodočnosti še nameniti določeno pozornost. Kajti, glede na obstoječi zakon o sodiščih bo potrebna uskladitev, če bo predlog predlagateljev zakonu sprejet kot tak. Sekretariat pa v nadaljevanju opozarja oziroma daje pripombe tudi na konkretne člene, in sicer k 2., 8., 10., 12., 14., 17., 30., 38., 40., 43., 49., 61. in 62. členu.