Na poti do naslednje stopnje čiščenja se odpadna voda v toplotnem izmenjevalniku segreje od 33 do 37 stopinj Celzija in zatem preide v rezervoar za kondicioniranje, kjer se z uravnavanjem pH-vrednosti optimira za potrebe reaktorja.
Dejanski postopek čiščenja namreč poteka v reaktorju, kjer bakterije predelujejo sestavine odpadne vode.